终于两个人成功的抵达到了火萤的基地。
面对乔尔，已经回到基地的火萤女皇马琳显得有一点不可思议。
因为她根本没能想到，乔尔与艾莉竟然能从波士顿隔离区，远渡千里找到火萤的基地。
然而接下来的对话，残酷的真相展现在玩家的面前。
根据马琳所说，虫草菌在艾莉的体内发生了异变。
所以艾莉才能够免疫病毒，但这种异变已经来到艾莉的脑部了。
想要搞清楚免疫的原理，研究员就必须移除掉蔓延到艾莉脑部的虫草菌，才能够进行反向研究出疫苗。
而这样的研究显然会要了艾莉的命。
乔尔让马琳找其他人去研究，但马琳告诉乔尔这不可能，因为二十年内只发现了艾莉一个人。
于是马琳将乔尔囚禁起来。
这一瞬间，乔尔就做出了抉择。
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